Biochemische und strukturelle Untersuchungen zur Funktion des an der Modifikation von tRNA beteiligten Guaninnukleotid-bindenden Proteins MnmE
- MnmE ist ein Guaninnukleotid-bindendes Protein, das an der Modifikation von tRNAs an der Wobble-Uridin Base 34 beteiligt ist. Diese tRNAs dekodieren Codon-Tripletts in gemischten Codon-Boxen. Es wird vermutet, daß MnmE zusammen mit dem Protein GidA die ersten Reaktionsschritte katalysiert, die zur Inkorporation einer Carboxymethylaminomethyl-Gruppe an Position 5 der Uridin-Base führt \((cmnm^{5}U34)\). Der detaillierte Mechanismus dieser Reaktion ist noch ungeklärt.
In dieser Arbeit wurde die Struktur des MnmE-Proteins im nukleotidfreien Zustand, die der \(GDP \cdot AlF_{4}^{-}\)-gebundenen G Domäne sowie die Struktur des Proteins GidA mittels Röntgenkristallographie charakterisiert. Basierend auf diesen strukturellen Informationen und biochemischen Untersuchungen wird ein Mechanismus für die Reaktion zur Modifikation der tRNA postuliert, nach dem MnmE eine katalytische und regulatorische Funktion ausübt.
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