Exploring conformational dynamics and equilibria of ABC transporters

  • ATP binding cassette (ABC) transporters form a significant super family of membrane proteins coupling the energy of ATP hydrolysis to substrate transport across the cell membrane. Unraveling transport and inhibition mechanisms is crucial to address several diseases caused by malfunction, over expression and mutation of ABC transporters. Several biochemical tools including electron microscopy and X-ray crystallography have aided the mechanistic characterization of many ABC transporters in static states of the transport cycle. While providing unprecedented insight into the mechanism, static states cannot explain the complete machinery. To achieve a full understanding, all the intermediate states as well as the collective behavior of transporters throughout the cycle need to be studied. Site-directed spin labeling and electron paramagnetic resonance (EPR) techniques provide invaluable information on dynamics, structure and function of ABC transporters under physiological conditions.
  • ATP-Bindungskassetten-Transporter bilden eine bedeutende Superfamilie von Membranproteinen, die Energie aus der Hydrolyse von ATP nutzen, um Substratmolekle über die Zellmembran zu transportieren. Ein detailliertes Verständnis der Transportmechanismen, sowie ihrer Inhibition ist notwendig, um Krankheiten zu bekämpfen, die durch Fehlfunktionen, Mutationen oder Überexpression von ABC-Transportern verursacht werden. Verschiedene biochemische Werkzeuge wie Elektronenmikroskopie oder Röntgenkristallographie haben tiefe Einblicke in die Struktur und Funktion von verschiedenen ABC-Transportern gegeben, jedoch liefern sie nur statische Einsichten in den Transportzyklus. Dazu sind zusätzliche Methoden nötig, die die Dynamik und die Zwischenzustände des Systems beschreiben können. Elektronenspinresonanz (ESR/EPR)-Spektroskopie in Kombination mit ortsspezifischer Spinmarkierung bietet leistungsstarke Werkzeuge um genau diese Dynamiken zu untersuchen.

Download full text files

Export metadata

Additional Services

Share in Twitter Search Google Scholar
Metadaten
Author:Mohammad Hadi TimachiGND
URN:urn:nbn:de:hbz:294-65214
DOI:https://doi.org/10.13154/294-6521
Subtitle (German):using electron paramagnetic resonance (EPR) spectroscopy
Referee:Lars V. SchäferORCiDGND, Eckhard HofmannORCiDGND
Document Type:Doctoral Thesis
Language:English
Date of Publication (online):2019/07/29
Date of first Publication:2019/07/29
Publishing Institution:Ruhr-Universität Bochum, Universitätsbibliothek
Granting Institution:Ruhr-Universität Bochum, Fakultät für Chemie und Biochemie
Date of final exam:2018/12/11
Creating Corporation:Fakultät für Chemie und Biochemie
GND-Keyword:Membranproteine; Elektronenspinresonanz; ELDOR; Doppelresonanz; Röntgenkristallographie
Dewey Decimal Classification:Naturwissenschaften und Mathematik / Chemie, Kristallographie, Mineralogie
Licence (German):License LogoKeine Creative Commons Lizenz - es gelten der Veröffentlichungsvertrag und das deutsche Urheberrecht