New insights into \(\textit {de novo}\) biogenesis of peroxisomes and into peroxisome proliferation in \(\textit {Saccharomyces cerevisiae}\)

  • A novel integral peroxisomal membrane protein, Pex34p, was found to interact with several other Peroxins in Pex3p, Pex19p, and Pex25p dependent manner. Fluorescence microscopic analysis of few double deletion strains revealed that 1) Pex3p-sfGFP after its reintroduction accumulates in structures which might represent ER and 2) When either of Pex25p or Pex34p was reintroduced, the phenotype of single deletion was not restored. Both these experiments point towards the role of Pex34p in \(\textit {de novo}\) biogenesis of peroxisomes. Complex isolation and mass spectrometry analysis of GFP tagged Pex34p revealed a novel putative binding partner, Mim1p, which is localized to the mitochondrial outer membrane, pointing towards a role of Pex34p as "tether" between Peroxisome-Mitochondria proximity contact sites (PerMit). The project also elucidated, Vam3p not being the docking partner for Vps1p at peroxisomal membrane. Fluorescence microscopy also revealed localization of Vam3p in proximity to peroxisomes.
  • Das neu entdeckte peroxisomales Membranprotein Pex34p interagiert mit zahlreichen anderen Peroxinen in einer Pex3p-, Pex19p- und Pex25p-abhängigen Weise. Fluoreszenzmikroskopie einiger Doppeldeletionsstämme zeigten, dass 1) Pex3p-sfGFP nach Reinduktion in Strukturen akkumuliert, die eventuell dem ER entsprechen und 2) bei Reinduktion von entweder Pex25p oder Pex34p der Einzeldeletionsphänotyp nicht wiederhergestellt werden konnte. Beide Experimente deuten auf eine Rolle von Pex34p in der peroxisomalen \(\textit {de novo}\)-Biogenese. Komplexisolierung und Massenspektrometrie von GFP-markiertem Pex34p zeigten einen neuen putativen Bindepartner, Mim1p, auf, welches an der äußeren mitochindrialen Membran lokalisiert ist und eine Rolle von Pex34p als Bindeglied zwischen \(\textit {Peroxisome-Mitochindria proximity contact sites}\) (PerMit) suggeriert. Das Projekt zeigte ebenso, dass Vam3p nicht der Bindepartner für Vps1p an der peroxisomalen Membran ist und Vam3p sich in der Nähe von Peroxisomen befindet.

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Metadaten
Author:Anirban ChakrabortyGND
URN:urn:nbn:de:hbz:294-64949
DOI:https://doi.org/10.13154/294-6494
Title Additional (German):Neue Einblicke in die \(\textit {de novo}\) Biogenese und Proliferation von Peroxisomen in \(\textit {Saccharomyces cerevisiae}\)
Referee:Ralf ErdmannORCiDGND, Christian HerrmannORCiDGND
Document Type:Doctoral Thesis
Language:English
Date of Publication (online):2019/07/09
Date of first Publication:2018/07/09
Publishing Institution:Ruhr-Universität Bochum, Universitätsbibliothek
Granting Institution:Ruhr-Universität Bochum, Fakultät für Chemie und Biochemie
Date of final exam:2018/10/12
Creating Corporation:Fakultät für Chemie und Biochemie
Tag:Biogenese; Mikroskopie
GND-Keyword:Peroxisom; Saccharomyces; Proliferation; De-Novo-Synthese; Protein-Protein-Wechselwirkung
Institutes/Facilities:Institut für Biochemie und Pathobiochemie, Abteilung für Systembiochemie
Dewey Decimal Classification:Naturwissenschaften und Mathematik / Chemie, Kristallographie, Mineralogie
faculties:Fakultät für Chemie und Biochemie
Licence (German):License LogoKeine Creative Commons Lizenz - es gelten der Veröffentlichungsvertrag und das deutsche Urheberrecht