Transkriptom- und Interaktomanalyse von \(\it miR-148a\) mittels mRNA-Microarray nach Biotin-miRNA-Pull-Down im duktalen Adenokarzinom des Pankreas

  • Die Dysregulation von miRNAs beeinflusst die Karzinogenese des duktale Adenokarzinoms des Pankreas (PDAC). Allerdings beruht die miRNA-Zielgen-Validierung bisher auf bioinformatischen Modellen, wobei sich viele potentielle Gene \(\textit {in vivo}\) nicht bestätigen. In dieser Arbeit wurde deshalb das Biotin-miRNA-Pull-Down-Präzipitationsverfahren für die tumorassoziierte \(\it miR-148a\) etabliert. Es zeigte sich eine kontextabhängige Identifikation von \(\it miR-148a\)-Ziel-mRNAs der Prädiktionsprogramme \(\it TargetScan\) und \(\it Pictar\) mit hoher Spezifität. Des Weiteren kam es durch Transkriptom-Modulation mittels Fibronektin zu einer Veränderung des \(\it miR-148a\)-Interaktoms von proliferations- zu migrationsassoziierten Zielgenen. Die folgenden funktionellen Analysen zeigten, dass die verminderte Expression von \(\it miR-148a\) bzw. die erhöhte der neuen Ziel-mRNA PPP1R10 zur höheren Aktivität des MEK-ERK-AP1-Signalwegs und zur verminderten Expression von MMP-9 führt, die an tumorassoziierten Prozessen im PDAC beteiligt sind.

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Metadaten
Author:Christoph Günter JungeGND
URN:urn:nbn:de:hbz:294-48605
Referee:Andrea TannapfelORCiDGND, Raphael StollORCiDGND
Document Type:Doctoral Thesis
Language:German
Date of Publication (online):2016/05/17
Date of first Publication:2016/05/17
Publishing Institution:Ruhr-Universität Bochum, Universitätsbibliothek
Granting Institution:Ruhr-Universität Bochum, Fakultät für Chemie und Biochemie
Date of final exam:2016/04/15
Creating Corporation:Fakultät für Chemie und Biochemie
Tag:Bauchspeicheldrüse
GND-Keyword:miRNS; RNS-Interferenz; Adenocarcinom; Biotin; Fibronectin
Institutes/Facilities:Institut für Pathologie
Dewey Decimal Classification:Naturwissenschaften und Mathematik / Biowissenschaften, Biologie, Biochemie
faculties:Fakultät für Chemie und Biochemie
Licence (German):License LogoKeine Creative Commons Lizenz - es gelten der Veröffentlichungsvertrag und das deutsche Urheberrecht