Transkriptom- und Interaktomanalyse von \(\it miR-148a\) mittels mRNA-Microarray nach Biotin-miRNA-Pull-Down im duktalen Adenokarzinom des Pankreas
- Die Dysregulation von miRNAs beeinflusst die Karzinogenese des duktale Adenokarzinoms des Pankreas (PDAC). Allerdings beruht die miRNA-Zielgen-Validierung bisher auf bioinformatischen Modellen, wobei sich viele potentielle Gene \(\textit {in vivo}\) nicht bestätigen. In dieser Arbeit wurde deshalb das Biotin-miRNA-Pull-Down-Präzipitationsverfahren für die tumorassoziierte \(\it miR-148a\) etabliert. Es zeigte sich eine kontextabhängige Identifikation von \(\it miR-148a\)-Ziel-mRNAs der Prädiktionsprogramme \(\it TargetScan\) und \(\it Pictar\) mit hoher Spezifität. Des Weiteren kam es durch Transkriptom-Modulation mittels Fibronektin zu einer Veränderung des \(\it miR-148a\)-Interaktoms von proliferations- zu migrationsassoziierten Zielgenen. Die folgenden funktionellen Analysen zeigten, dass die verminderte Expression von \(\it miR-148a\) bzw. die erhöhte der neuen Ziel-mRNA PPP1R10 zur höheren Aktivität des MEK-ERK-AP1-Signalwegs und zur verminderten Expression von MMP-9 führt, die an tumorassoziierten Prozessen im PDAC beteiligt sind.
Author: | Christoph Günter JungeGND |
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URN: | urn:nbn:de:hbz:294-48605 |
Referee: | Andrea TannapfelORCiDGND, Raphael StollORCiDGND |
Document Type: | Doctoral Thesis |
Language: | German |
Date of Publication (online): | 2016/05/17 |
Date of first Publication: | 2016/05/17 |
Publishing Institution: | Ruhr-Universität Bochum, Universitätsbibliothek |
Granting Institution: | Ruhr-Universität Bochum, Fakultät für Chemie und Biochemie |
Date of final exam: | 2016/04/15 |
Creating Corporation: | Fakultät für Chemie und Biochemie |
Tag: | Bauchspeicheldrüse |
GND-Keyword: | miRNS; RNS-Interferenz; Adenocarcinom; Biotin; Fibronectin |
Institutes/Facilities: | Institut für Pathologie |
Dewey Decimal Classification: | Naturwissenschaften und Mathematik / Biowissenschaften, Biologie, Biochemie |
faculties: | Fakultät für Chemie und Biochemie |
Licence (German): | Keine Creative Commons Lizenz - es gelten der Veröffentlichungsvertrag und das deutsche Urheberrecht |