Structural characterization of the antiapoptotic protein Bcl-x\(_{L}\) and the NDH-1 complex subunit CupS by X-ray crystallography and NMR spectroscopy

  • The antiapoptotic protein Bcl-xL is overexpressed in some tumors and is thus an important target for drug design. It can be found both in the cytosol and at the mitochondrial membrane. For the localization to the mitochondrial membrane its C-terminus, which has been predicted to be a transmembrane domain, is important, but structural studies have only been performed on truncated forms lacking the C-terminal part. This work concentrates on the expression of full-length Bcl-xL, first X-ray and NMR experiments of this form as well as studies in a membrane environment (LDAO micelles). The cyanobacterial protein CupS is one of the various subunits of the NAD(P)H dehydrogenase type 1 (NDH-1) complex. This work describes the structural investigation of CupS from \(\textit {Thermosynechococcus elongatus}\) by NMR spectroscopy. The backbone and side chain chemical shifts were determined using a combination of various NMR spectra and the solution structure of CupS was calculated.
  • Das antiapoptotische Protein Bcl-xL wird in einigen Tumoren überexprimiert und spielt daher eine wichtige Rolle in der Medikamentenforschung. Es kommt sowohl im Cytosol als auch an der Mitochondrienmembran vor. Für die Membranlokalisation ist der C-Terminus wichtig, der die Funktion einer Transmembrandomäne übernimmt. Allerdings wurden die meisten strukturellen Studien ohne den C-Terminus durchgeführt. Diese Arbeit beschreibt die Expression von full-length Bcl-xL, erste röntgenkristallographische und NMR-Experimente, sowie Studien in einer membranähnlichen Umgebung (LDAO-Mizellen). Das cyanobakterielle Protein CupS ist Untereinheit des NAD(P)H-Dehydrogenase Typ 1 (NDH-1) Komplexes. Diese Arbeit beschäftigt sich mit der strukturellen Untersuchung von CupS aus \(\textit {Thermosynechococcus elongatus}\) mittels NMR-Spektroskopie. Die chemischen Verschiebungen des Protein-Backbones und der Seitenketten wurden bestimmt und die Struktur des Proteins wurde berechnet.

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Metadaten
Author:Annika KorsteGND
URN:urn:nbn:de:hbz:294-47543
Referee:Raphael StollORCiDGND, Peter BayerGND
Document Type:Doctoral Thesis
Language:English
Date of Publication (online):2016/03/31
Date of first Publication:2016/03/31
Publishing Institution:Ruhr-Universität Bochum, Universitätsbibliothek
Granting Institution:Ruhr-Universität Bochum, Fakultät für Chemie und Biochemie
Date of final exam:2014/08/29
Creating Corporation:Fakultät für Chemie und Biochemie
GND-Keyword:NMR-Spektroskopie; Proteine; Röntgenkristallographie; Strukturaufklärung; Apoptosis
Institutes/Facilities:Lehrstuhl Biochemie II, Arbeitsgruppe Biomolekulare NMR-Spektroskopie
Dewey Decimal Classification:Naturwissenschaften und Mathematik / Biowissenschaften, Biologie, Biochemie
faculties:Fakultät für Chemie und Biochemie
Licence (German):License LogoKeine Creative Commons Lizenz - es gelten der Veröffentlichungsvertrag und das deutsche Urheberrecht