Sequence-addressed assemblies of trisoligonucleotides into nanoscale motifs and structural studies

  • Trisoligonukleotide sind Bausteine zur Herstellung von DNA-basierten Nanokonstrukten, u.a. Tetraedern. Die Synthese des benötigten C(3h)-symmetrischen Linkers wurde optimiert. Der Einfluss der Alkylen-Kettenlänge am Linker in Hinblick auf die Flexibilität des Bausteins wurde in Hybridisierungs- und Verdauexperimenten untersucht. Ethylen-Ketten erlauben diesbezüglich den Aufbau von stabilen tetraedrischen Gerüsten. In diesem Zusammenhang wurde eine neue Generation von leicht zu synthetisierenden Isocyanurat-basierten Linkern eingeführt. Ein alternatives Sequenzmuster für Trisoligonukleotide ("DOS") wurde untersucht, welches zu Situationen unterhalb der maximalen Instruktion führt. Neue denkbare Motive waren damit zugänglich, die das Repertoire an möglichen Nanostrukturen erweiterten. Interkalationsexperimente von Tetraedern mit Anthracyclinen verglichen mit linearer DNA deuten auf zusätzliche Bindungstaschen nahe den Ecken hin, die die maximal mögliche Beladung von Duplex DNA erweitert.

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Metadaten
Author:Christos PanagiotidisGND
URN:urn:nbn:de:hbz:294-47487
Referee:Günter von KiedrowskiGND, Frank SchulzORCiDGND
Document Type:Doctoral Thesis
Language:English
Date of Publication (online):2016/03/29
Date of first Publication:2016/03/29
Publishing Institution:Ruhr-Universität Bochum, Universitätsbibliothek
Granting Institution:Ruhr-Universität Bochum, Fakultät für Chemie und Biochemie
Date of final exam:2016/02/29
Creating Corporation:Fakultät für Chemie und Biochemie
Tag:Fluoreszenz; Interkalation; Quenching
GND-Keyword:DNS; Nanotechnologie; Linker; Selbstorganisation; Tetraederstruktur
Institutes/Facilities:Lehrstuhl für Organische Chemie I, Bioorganische Chemie
Dewey Decimal Classification:Naturwissenschaften und Mathematik / Chemie, Kristallographie, Mineralogie
faculties:Fakultät für Chemie und Biochemie
Licence (German):License LogoKeine Creative Commons Lizenz - es gelten der Veröffentlichungsvertrag und das deutsche Urheberrecht